潔淨室的設計需要注意的地點很多，國際上為了統一潔淨室的空氣質量製定了相應的潔淨室標準，之所以要如此嚴格的要求，很大一部分是由潔淨室的功能決定的。潔淨室中製備的都是對汙染非常敏感的零件。因此其裝修工程也需要遵循非常嚴格的規定。
一、潔淨室吊頂的安裝，分為幹吊頂和濕吊頂。幹吊頂是為了在通風口處安裝空氣高效過濾器，濕吊頂則是為了安裝過濾器的配套設備。需要注意的是濕吊頂需要密封，密封要用能夠填充構形間隙的密封膠。
二、潔淨室的規模要隨著生產工藝的優化而變換，因此空間分隔不應太嚴格，最好用鋁合金板材來當車間牆壁，拆卸比較簡便。
三、做任何事情都是安全當先，所有的施工人員在進行裝修工程之前都必須進行安全教育，牢記一旦工作就要帶安全帽和安全服，危險區域要放置警告標語，消防設施要放在容易取得的位置，並且工人們要接受消防教育。完成每日工作以後，清理現場的垃圾廢物，以免對以後的施工產生影響。
現代科學技術的發展產生了潔淨室這一特殊的設施，因此潔淨室的裝修工程和普通的裝修有很大的區別，因此最好聘請專業的潔淨室裝修公司，遵循裝修工程的國家規定。畢竟潔淨室中製備的零件都是對汙染極其敏感的，因此潔淨室的裝修一定不能掉以輕心。
